ERS 2022: Human Lung Cell Atlas klaar voor gebruik

Onlangs is de geïntegreerde Human Lung Cell Atlas (HLCA) gereedgekomen. Tijdens het ERS-congres legde dr. Malte Lücken uit hoe deze bron van ruim 2,2 miljoen cellen gebruikt kan worden, bijvoorbeeld om onderzoeksdata aan een snelle analyse te onderwerpen. Integratie van afzonderlijk datasets Atlassen van afzonderlijke cellen bieden beelden in hoge resolutie van cellen binnen weefsels en organen. Deze beelden hebben geleid tot de ontdekking van nieuwe celtypen en ontwikkelingsprocessen, en tot kennis over de invloed van ziekten op cellulair niveau. Er waren al veel datasets van longcellen beschikbaar. De makers van de HLCA hebben nu de beschikbare datasets, 46 in getal, geïntegreerd, zodat onderzoekers de datasets niet afzonderlijk hoeven af te gaan. Op deze geïntegreerde data kunnen allerlei onderzoeksvragen worden losgelaten. Zo is bijvoorbeeld gekeken welk celtype factoren tot expressie brengt die het coronavirus gebruikt om cellen binnen te dringen. Hierbij is het wel belangrijk te controleren of de gebruikte datasets dezelfde definitie van celtypes hebben gehanteerd, en in het achterhoofd te houden dat de populatie die voor een dataset is ingezet specifieke…