Seizoenen beïnvloeden genexpressie in hogere luchtwegen

Seizoensveranderingen dragen bij aan de variabiliteit van genexpressie in de bovenste luchtwegen. Die bevinding presenteerde Tatiana Karp (Groningen) op het recente ERS-congres in Milaan. Seizoensveranderingen veroorzaken een wisselende blootstelling aan allergenen, temperatuur en luchtvochtigheid, wat van invloed kan zijn op de genexpressie in verschillende weefsels.

Aangezien de bovenste luchtwegen, met name het neusepitheel, een belangrijke barrièrefunctie hebben tegen veranderingen uit de omgeving, was het van belang te onderzoeken welke invloed seizoensveranderingen hebben op de genexpressie in dit deel van de luchtwegen. Karp en een team van multinationale collega's verrichtten een differentiële genexpressie-analyse met nasale brushmonsters van gezonde en astmatische deelnemers aan de ATLANTIS-studie. De data omvatten 201 monsters in voorjaar en zomer (tussen 1 maart en 31 augustus) en 217 monsters in herfst en winter.

In de voorjaars- en zomerperiode kwamen 949 genen in het neusepitheel meer tot expressie en 1069 genen verminderd, vergeleken met de periode herfst-winter (FDR<0,05). De seizoensgeassocieerde genen lieten eenzelfde patroon zien bij mensen met en zonder astma en allergie, wat volgens Karp suggereert dat de variatie in seizoensgebonden genexpressie onafhankelijk is van luchtweg- en allergische aandoeningen. Karp concludeert dat seizoensveranderingen bijdragen aan de variabiliteit van genexpressie in de hogere luchtwegen en pleit daarom voor een correctie voor seizoensgebonden veranderingen bij het bestuderen van astmagerelateerde genexpressie.