Microbioom bij SLE: auto-immunogeen en pro-inflammatoir

Het darmmicrobioom van niet-behandelde patiënten met systemische lupus erythematosus (SLE) heeft een auto-immunogeen en pro-inflammatoir profiel, wat werd bevestigd in een muizenmodel. Feces van 117 niet-behandelde SLE-patiënten, 52 behandelde SLE-patiënten en 115 gematchte gezonde controles werd geanalyseerd met whole-genome profiling. Het darmmicrobioom van SLE-patiënten verschilde significant in samenstelling en functie van dat van gezonde controles.

Soorten als Clostridium sp. ATCC BAA-442, Atopobium rimae, Shuttleworthia satelles, Actinomyces massiliensis, Bacteroides fragilis en Clostridium leptum waren toegenomen bij SLE-patiënten en namen na behandeling weer af. Ook werd een verhoogde synthese van lipopolysacchariden gezien, samen met een afgenomen synthese van vertakte aminozuren.

Het fecale metagenoom van MRL/lpr-muizen kwam overeen met de bevindingen bij patiënten, en sommige soorten met oorsprong in de mondflora bleken toegenomen in de darmen van SLE-patiënten. Functionele validatie-assays toonden pro-inflammatoire capaciteiten aan van microbiële peptiden afkomstig van bij SLE toegenomen soorten. Deze grootschalige metagenomische studie laat een afwijkend microbioomprofiel bij SLE zien en biedt een rationale om het microbioom als mogelijke adjuvante behandeling te onderzoeken.