ERS 2020 video: Microbiologische patronen bij pleurale infectie vastgesteld met NGS

Dr. Joris ten Holder, longarts HaaglandenMC, selecteerde en bespreekt het volgende onderzoek: Poster 4673- Onderzoekers uit Oxford ontwikkelden een methodologie om bacterieel DNA te extraheren uit patiënten met een pleurale infectie. Ze gebruikten dit als een template om next generation sequencing (NGS) toe te passen en vonden dat 16S rRNA NGS een robuuste methode biedt om in het pleuravocht van patiënten met pleurale infectie de bacteriologische patronen te onderzoeken. Een pleurale infectie is een veelvoorkomende en complexe ziekte die voor immuungecompromitteerde en oudere patiënten levensbedreigend kan zijn. Als gevolg van eerder antibioticagebruik en speciale bacteriële voedingsbehoeftes is het lastiger om nauwkeurig met behulp van de huidige kweekgebaseerde technieken bacteriën vast te stellen. Daardoor blijft de microbiologie van een pleurale infectie onduidelijk. Met behulp van NGS is het wellicht mogelijk om de aanwezige bacteriën op een betere manier in kaart te brengen. NGS-analyses Pleurale vloeistofmonsters, die werden verkregen vanuit de Pleural Infection Longitudinal Outcome Study Pleurale infectie Longitudinal Outcome Study (PILOT), ondergingen…